Glu in gluten
söndag 19 januari 2025
Toiset muunta vehnän gliadiinigeeniä, toiset taas vehnän excitatorisen aminohapon Glu (E/Q) rakennetta . Toiset tekevät vahvempaa gluteenia, rehua.
Haku "Hordein antibodies". Hordein on ohran prolamiini ja ohra taas kuuluu gluteeni muodostaviin viljoihin.
2,907 results
lördag 23 november 2024
Lasten diagnosoimattomasta tai hoitamattomasta keliakiasta tulevaista ongelmaa
Hakusana: Gene behind NALFD? ( Yksinkertainen oire NAFLD taudista, nonalkoholiesta rasvamaksataudista, on rasvaripuli (steatorrhea) , kelluvat ulosteet ja ulosteioden epätavallinen väri ja hajukin riippuen suolistn biomin tilasta ja maksantoiminansta. Aikuisten NAFLD Review PubMed lätheessä antaa yli 10 100 artikkelia ja uusimmat ovat aivan tältä kuulta vuonna 2024.
Intestinal gluconeogenesis is downregulated in pediatric patients with celiac disease
- PMID: 36369023
- PMCID: PMC9652951
- DOI: 10.1186/s12916-022-02635-3
Background: Untreated celiac disease (CD) patients have increased levels of blood glutamine and a lower duodenal expression of glutaminase (GLS). Intestinal gluconeogenesis (IGN) is a process through which glutamine is turned into glucose in the small intestine, for which GLS is crucial. Animal studies suggest impaired IGN may have long-term effects on metabolic control and be associated with the development of type 2 diabetes and non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD). The aim of this study was to thoroughly investigate IGN at the gene expression level in children with untreated celiac disease.
Methods: Quantitative polymerase chain reaction (qPCR) was used to quantify the expression of 11 target genes related to IGN using the delta-delta Ct method with three reference genes (GUSB, IPO8, and YWHAZ) in duodenal biopsies collected from 84 children with untreated celiac disease and 58 disease controls.
Results: Significantly lower expression of nine target genes involved in IGN was seen in duodenal biopsies from CD patients compared with controls: FBP1, G6PC, GLS, GPT1, PCK1, PPARGC1A, SLC2A2, SLC5A1, and SLC6A19. No significant difference in the expression was observed for G6PC3 or GOT1.
Conclusions: Children with untreated celiac disease have lower expression of genes important for IGN. Further studies are warranted to disentangle whether this is a consequence of intestinal inflammation or due to an impaired metabolic pathway shared with other chronic metabolic diseases. Impaired IGN could be a mechanism behind the increased risk of NAFLD seen in CD patients.
Keywords: Celiac disease; Gluten; Non-alcoholic fatty liver disease; intestinal gluconeogenesis.
© 2022. The Author(s).
Conflict of interest statement
The authors declare that they have no competing interests.
måndag 12 juni 2023
Katson geeneistä PREP ja PREPL jotain niiden vaikutuksista.
Tämä on vasta bulk-alkuhakua. Katson ajan mittaan vähän vähemmäksi tämän artikkelin sisällön. Kyse on prolyyliä pilkkova entsyymi. se pilkkoo oligopeptidin C_terminaalista. PREPL ei pilko arginiinin tai lysiinin jälkeen (R tai K) ja se on muutenkin erilainen hieman rakennepiirteiltään, kuten esim sisältää runsaasti cysteinejä (C) ihan riittäisi sinkkisormeksikin ja rakenne on miltei puolipropellinen. Toimivatkohan nuo peräkanaa?
(*) TÄSTÄ KIRJOITTAA DUODECIM 11/23
Katson GENECARDS lähteestä : “PREP” ja sen jälkeen PREP
Tekstit mainitsevat että se jollain tavalla osallistuu inositolin aineenvaihduntaan, joten katson tarkemmin. Lisäksi se puuttuu QPPAQP etc. sisältävien peptidien pilkkoutumiseen. Joita uodostuss gluteenipitoisesta ravinnosta. Huomaan että se on selektiivisesstio peptidien C-terminaalisen proliinin pilkkoja ja tuotaa oligopeptidilopputuotteita eikä esim. erillisiä proliineja tai erillisiäaminohappoja. Sen rakenteessa ei näy tavallisia Znf sinkkisormimahdollisuuksia. Se on aika järjestäytynyt beetanauhojensa ja alfahelixiensä suhteen.Se ei vaikuta suoraan sigannlivälittäjään IP3 itse vaan sen kinaasisäätelyjärjestelmään, joka on saateaa olla laaja. Siitä tietoisuus on kasvanut nyt vuosituhannen vaihteen jälkeen.
* HAKU GENE CARDS “PREP Showing 25 of 2,755 results for PREP Search Time: 0 ms.
PREP (6q21). Prolyl oligoendopeptidases GENECARDS haku 12.6. 2023 .
Aliases for PREP Gene
The protein encoded by this gene is a cytosolic prolyl endopeptidase that cleaves peptide bonds on the C-terminal side of prolyl residues within peptides that are up to approximately 30 amino acids long. Prolyl endopeptidases have been reported to be involved in the maturation and degradation of peptide hormones and neuropeptides. [provided by RefSeq, Jul 2008]
GeneCards Summary for PREP Gene: PREP (Prolyl Endopeptidase) is a Protein Coding gene. Diseases associated with PREP include Amnestic Disorder and Post-Traumatic Stress Disorder. Gene Ontology (GO) annotations related to this gene include serine-type endopeptidase activity and serine-type exopeptidase activity. An important paralog of this gene is PREPL.
UniProtKB/Swiss-Prot Summary for PREP Gene: Cleaves peptide bonds on the C-terminal side of prolyl residues within peptides that are up to approximately 30 amino acids long. ( PPCE_HUMAN,P48147 )
Show:
Description |
UniProt ID |
|||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
Prolyl Endopeptidase |
Protein Coding |
P48147 |
49 |
GC06M105277 |
43.35 |
||
|
(x) Pharmacol Res
- 2020 Jan;151:104558. doi: 10.1016/j.phrs.2019.104558. Epub 2019 Nov 20.Prolyl oligopeptidase inhibition activates autophagy via protein phosphatase 2A Reinis Svarcbahs 1 , Maria Jäntti 1 , Tommi Kilpeläinen 1 , Ulrika H Julku 1 , Lauri Urvas 1 , Saara Kivioja 1 , Susanna Norrbacka 1 , Timo T Myöhänen DOI: 10.1016/j.phrs.2019.104558
- Abstract. Prolyl oligopeptidase (PREP) is a serine protease that has been studied particularly in the context of neurodegenerative diseases for decades but its physiological function has remained unclear. We have previously found that PREP negatively regulates beclin1-mediated macroautophagy (autophagy), and that PREP inhibition by a small-molecule inhibitor induces clearance of protein aggregates in Parkinson's disease models. Since autophagy induction has been suggested as a potential therapy for several diseases, we wanted to further characterize how PREP regulates autophagy. We measured the levels of various kinases and proteins regulating beclin1-autophagy in HEK-293 and SH-SY5Y cell cultures after PREP inhibition, PREP deletion, and PREP overexpression and restoration, and verified the results in vivo by using PREP knock-out and wild-type mouse tissue where PREP was restored or overexpressed, respectively. We found that PREP regulates autophagy by interacting with protein phosphatase 2A (PP2A) and its endogenous inhibitor, protein phosphatase methylesterase 1 (PME1), and activator (protein phosphatase 2 phosphatase activator, PTPA), thus adjusting its activity and the levels of PP2A in the intracellular pool. PREP inhibition and deletion increased PP2A activity, leading to activation of death-associated protein kinase 1 (DAPK1), beclin1 phosphorylation and induced autophagy while PREP overexpression reduced this. Lowered activity of PP2A is connected to several neurodegenerative disorders and cancers, and PP2A activators would have enormous potential as drug therapy but development of such compounds has been a challenge. The concept of PREP inhibition has been proved safe, and therefore, our study supports the further development of PREP inhibitors as PP2A activators.Keywords: Alzheimer’s disease; Bafilomycin A1 (PubChem CID: 6436223); FTY-720 (fingolimod, PubChem CID: 107970); KYP-2047 (PubChem CID: 11198569); Neurodegeneration; Okadaic acid (PubChem CID: 446512); PP242 (PubChem CID: 135565635); Parkinson’s disease; Protein phosphatase 2 phosphatase activator; Protein phosphatase methylesterase 1; Rapamycin (sirolimus, PubChem CID: 5284616); Serine protease. Copyright © 2019 Elsevier Ltd. All rights reserved.
Similar articles
Deletion or inhibition of prolyl oligopeptidase blocks lithium-induced phosphorylation of GSK3b and Akt by activation of protein phosphatase 2A. Myöhänen TT, Mertens F, Norrbacka S, Cui H. Basic Clin Pharmacol Toxicol. 2021 Oct;129(4):287-296. doi: 10.1111/bcpt.13632. Epub 2021 Jul 20. PMID: 34196102
Prolyl oligopeptidase inhibition reduces oxidative stress via reducing NADPH oxidase activity by activating protein phosphatase 2A. Eteläinen T, Kulmala V, Svarcbahs R, Jäntti M, Myöhänen TT. Free Radic Biol Med. 2021 Jun;169:14-23. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2021.04.001. Epub 2021 Apr 7. PMID: 33838285
The effect of prolyl oligopeptidase inhibitors on alpha-synuclein aggregation and autophagy cannot be predicted by their inhibitory efficacy. Kilpeläinen TP, Hellinen L, Vrijdag J, Yan X, Svarcbahs R, Vellonen KS, Lambeir AM, Huttunen H, Urtti A, Wallen EAA, Myöhänen TT. Biomed Pharmacother. 2020 Aug;128:110253. doi: 10.1016/j.biopha.2020.110253. Epub 2020 May 22. PMID: 32447211
New tricks of prolyl oligopeptidase inhibitors - A common drug therapy for several neurodegenerative diseases. Svarcbahs R, Julku U, Kilpeläinen T, Kyyrö M, Jäntti M, Myöhänen TT. Biochem Pharmacol. 2019 Mar;161:113-120. doi: 10.1016/j.bcp.2019.01.013. Epub 2019 Jan 17. PMID: 30660495 Review.
'How can I halt thee?' The puzzles involved in autophagic inhibition. Vinod V, Padmakrishnan CJ, Vijayan B, Gopala S. Pharmacol Res. 2014 Apr;82:1-8. doi: 10.1016/j.phrs.2014.03.005. Epub 2014 Mar 21. PMID: 24657238 Review. Abstract
The strategy for interpreting the role of autophagy on the basis of evidence obtained through autophagic inhibition sounds logical, but is beset with practical constraints. The knock down of autophagy-related (ATG) gene(s) or blockage of class III PI3-Kinase are the most common approaches for inhibiting autophagy. However, during stressful conditions, autophagy may operate in synchrony with other processes such as apoptosis; autophagy-related genes, unlike what their name implies, exert their regulation on apoptosis as well. Knocking down such genes not only blocks autophagy but also renders apoptosis defective, making the interpretation of autophagic roles unreliable. Similarly, class III PI3-Kinase aids in initiating autophagy but it is not a quintessential autophagic regulator. Class III PI3-Kinase also has a role in regulating almost all membrane transport in cells. Blocking it not only inhibits autophagy, but also hampers all the membrane trades, including endosomal transport. The pharmacological inhibitors used to block autophagy by blocking class III PI3-Kinase further compound these limitations with their off-target effects. Knowing the limitations involved in blocking a target or using an autophagy-blocking tool is a prerequisite for designing the experiments meant for analyzing autophagic functions. This review attempts to provide a detailed overview about the practical constraints involved in using autophagic inhibition as a strategy to understand autophagy.Keywords: 3-Methyladenine; 3-Methyladenine (PubChem CID: 1673); Ammonium chloride (PubChem CID: 25517); Apoptosis; Atg5; Autophagy; Bafilomycin A1 (PubChem CID: 6436223); Beclin1; Chloroquine (PubChem CID: 2719); E64d (PubChem CID: 393035); KU55933 (PubChem CID: 5278396); Monensin (PubChem CID: 28263); Wortmannin (PubChem CID: 312145). Copyright © 2014 Elsevier Ltd. All rights reserved.
See all similar articles
(*) Toinen
HAKU “PREPL”(2p21)
Selected DME Specific Peptides for PREP Gene
- P48147:
-
- KQHFEWL
- LCAEFPDEPKWMGGAELSDDGRYVLLSI
- TNEGTVFTFKTNR
- VFREVTVKGIDA
- AYGLSASGSDWVTIKFMKVDGAKEL
- TKIPMFI
- IYHCDLTKEELEP
- NQRPDLF
- RGGGEYG
- GGSNGGLL
- GILKWVKLIDNFEGEYDY
- FKKGKRYFYFYNTGLQNQRVLYVQDSLEGEARV
- QDYHGHK
- EIFYQFTSFLSPG
- TIGHAWTTDYGCSD
- AAEYLIKE
- YPQQDGKSDGTETSTNLHQKL
- YHGHKICDPY
- TGALLKTFPL
- YGGFNIS
- KYSPLHNVKLPEADDIQYPSMLLLTADHDDRVVPLHS
- VGVMDML
- See less «
b) ( PARALOG GENE Tässä paralogissa on useita cysteiinejä, rakenne on puoli propellimainen verattuna edelliseen ja se katsotaan solunsisäiseksi, osallistu retrogradisen suunnan liikutteluun. Endosomi Golgi, Golgi PM, ja lopulta Ja lopulta mm synaptisen vesikkelin erityksiin)
Aliases for PREPL Gene 2p21.
Gene Families for PREPL Gene
IUPHAR :S9: Prolyl oligopeptidase
Disease related genes
Enzymes
Human disease related genes
Potential drug targets
Predicted intracellular proteins
Protein Domains for PREPL Gene
InterPro:
Blocks:
Prolyl oligopeptidase serine protease (S9A) signature
Suggested Antigen Peptide Sequences for PREPL Gene
GenScript: Design optimal peptide antigens:
Prolylendopeptidase-like (PPCEL_HUMAN)
Graphical View of Domain Structure for InterPro EntryQ4J6C6 UniProtKB/Swiss-Prot:PPCEL_HUMAN :
Belongs to the peptidase S9A family.
Molecular function for PREPL Gene according to UniProtKB/Swiss-Prot
Function:
Serine peptidase whose precise substrate specificity remains unclear (PubMed:16143824, 16385448, 28726805).
Does not cleave peptides after a arginine (R) or lysine (K) residue (PubMed:16143824).
Regulates trans-Golgi network morphology and sorting by regulating the membrane binding of the AP-1 complex (PubMed:23321636).
May play a role in the regulation of synaptic vesicle exocytosis (PubMed:24610330). PPCEL_HUMAN,Q4J6C6
EnzymeRegulation:
Inhibited by PMSF and Prefabloc, as well as leupeptin at high concentrations (PubMed:16385448).
Partially inhibited by TPCK, a chymotrypsin inhibitor and E64, a cysteine protease inhibitor (PubMed:16385448).
Not affected by 4-amidinophenyl-methanesulfonyl fluoride (APMSF), pepstatin or EDTA (PubMed:16385448).
Inhibited by 1-isobutyl-3-oxo-3,5,6,7-tetrahydro-2H-cyclopenta[c]pyridine-4-carbonitrile (PubMed:28726805). PPCEL_HUMAN,Q4J6C6
Phenotypes for PREPL Gene MGI mutant phenotypes for PREPL:
GenomeRNAi human phenotypes for PREPL:
lördag 10 juni 2023
Gluteenin ruoansulatuspätkistä tulee paljon QP-rakenteisiä peptidejä. proly -glutamyl- prolyl ym oligopeptidejä
AJATUKSIANI 10.6. 2023.
Jos on entsyymivajetta siinä vaiheesas, missä näitä proliinj-proliini, (PP) proliiniglutamiini (PQ)ja glutamiiniglutamiini (QQ) ja glutamiiniproliini (QP) sidoskohtia ei pilkkoudukaan ja jää eräänlaisia T-solujen havaitsemia oligopeptidejä ja ne ovat antigeenejä.
Neuronaalinen signalointi vaatii yksittäisten glutamiinista (Q) muodostuvien glutamiinihappojen (E) tai GABA gamma-aminovoihappojen hyvää mudostumista ja sykliä. GLU on excitatorinen, GABA inhibitorine ja GLN antaa vapaata sidosenergiaa kohdissa, missaä ei ole mahdollista käyttää isoja ATP tai pienempiäkään rikastuneita inositoliperäisiä fosfaatteja energialähteinä. Siis Q on se ilmainen energialähde, E on stimuloiva ja GABA inhiboiva. Tähän ydinmoduliin reseptorisettiensä kanssa perustuu neuronien muistin lataustoiminta ja muistin esiinhakemistoiminta.
Haitallinen rakenne on Hungington-viruksessa, sillä siinä on näitä PPP ja QP jaksoja, joita keho ei pysty kaikilla kai pilkkomaan proteosomissa ja immuunivasteessa.Jptkut virusrakenteet vehnän tapaan suosivat näitä aminohappoja. https://www.mdpi.com/biomolecules/biomolecules-10-01458/article_deploy/html/images/biomolecules-10-01458-g001.png
Nyt on hiirillä huomattu että muistin latauksessa ja esiinotossa tärkeät aivojen etuosat hiirillä voivat olla muistihäiriön ayntyalue ja siten kun on tällaisia haittapeptidejä paljon siihen on keksitty entsyymin estäjä. ja hiirien muisti paranee.
Varmaan hieno asia , mutta tuohon järjestelmään pitää asettaa eliminaatiodieetti:jolloin samaan heikkoon aineenvaihdunnalliseen linkkiin tulisi tukea tiukasta ( gluteenittomasta dieetistä, jolloin näitä oligopeptidejä ei jäisi sulamatta niin suunnattomia määriä kehoon, mikä säätää tuollaista sekundääristi entsyymiä ylös. Se onkin siten paradigma, joka vain pitäisi ottaa huomioon.
Sen sijaan että keksitään esim desensitoimisteitä kuten vähemmän gluteenisen ( aveniiniprolamiinityyppisen) kauran palauttamista laajalti keliakiadieettiin, voisi löytää sen entsyymin, josta ytimissä on kysymys primääristi. ja siten voi esikäsitellä ne sidokset ja jos se ei auta, tekijä on myös jokin toinenkin, lektiinitaso tms.
Toistaiseksi suosittelen englantilaista linja, jossa ei palautteta kauraa vielä, koska kerran ei tiedetä primääriä entsyymivajetta.
Uusi Duodecim 2023 ; 139;841.kertoo artikkelissa Prolyylioligopeptidaasien estäjistä apua muistisairauksien pysäyttämiseen?
tisdag 14 mars 2023
JUOMAVESI Erityinen tieteellinen artikkeli (2020) eräästä vuoristoperäisestä terveysvedestä (LCMW) Espanjasta
Tämä on sikäli erikoinen kuvaus, että siinä yksityiskohtaisesti(koeläimillä) esitetään suolinukkapinnan muutosta tämän terveysvesikuurin aikutuksesta. Tosin tässä on koe-eläinten ehjä perusnukka eikä ihmisen keliakian jo kaivertama ja latistama nukkaatrofinen (VA) tilanne :
1) Ainutlaatuisen terveysveden Lanjaro-Capucchino-Mineral waater- kuvaus espanjalaisessa tutkimuksessa, joka selvittää koe-eläintutkimusken avulla tmän erityisen mineraalipitoisen vuoristoveden vaikutusta suoliston erilaisiin funktionaalisiin häiriöihin. Tässä mineraalivedessä on
Order Article Reprints Open AccessArticle Effects of Sodium Chloride-Rich Mineral Water on Intestinal Epithelium. Experimental Study by Pascual-Vicente Crespo1,†, Fernando Campos1,†,Manuel Leal2 and Francisco Maraver2,3,*Tissue Engineering Group, Department of Histology, University of Granada, 18016 Granada, Spain2 Professional School of Medical Hydrology, Complutense University of Madrid, Plaza Ramón y Cajal s/n, 28040 Madrid, Spain3 Medical Hydrology Group, Department of Radiology, Rehabilitation & Physiotherapy, Complutense University of Madrid, Plaza Ramón y Cajal s/n, 28040 Madrid, Spain*Author to whom correspondence should be addressed. †
These authors contributed equally to this work. Int. J. Environ. Res. Public Health 2021, 18(6), 3261; https://doi.org/10.3390/ijerph18063261 Received: 29 December 2020 / Revised: 20 February 2021 / Accepted: 19 March 2021 / Published: 22 March 2021 (This article belongs to the Special Issue Health Resort Medicine: Resources and Applications in Environmental Health)
2) LCMW Mineraalipitoisen veden lähde Espanjassa:
Balneario de Lanjarón en Granada, Andalucía. Relais Termal, cadena líder de Balnearios de España
Thermal Spa
Six
minero-medicinal springs
The prestige of Lanjarón as a
thermal baths is down to the variety and quality of its waters.
Thermal baths
The fault of Lanjarón, forming the border between the unique landscapes of the Sierra Nevada and the Alpujarras explains the profusion of streams around the village. The different rocks of this area allow the rainwater fallen years ago in Sierra Nevada to be filtered back the surface for our benefits.
Some of these waters were in contact during years with minerals that is why they are so valuable because the very high concentration of minerals they have. Others springs come from the fusion of the perpetual snows and rains and hence exceptionally pure water with less minerals.
https://www.mdpi.com/1660-4601/18/6/3261
3) Minerallivesiterapioitten hyödyllistä osuudesta post-Covid oireisiin? Ainakin suomalaisen kannattaa katsoa minkäkaltaista vettä käyttää ne 366 päivää vuodessa. Ei ihme että ulkomaanmatkat Välimeren ilmastoon ovat piristeeksi ja hyvin suosittuja. Omasta mielestäni oli mahtavan keveä hengittää esim Israelin suolameren rannan ilmastossa tai Kinneretin rannoilla. Siellä mienraalipitoisuus on toista luokkaa myös verrattuna Suomen juomavesiin. Eipä ihme että suomalaiset virkistyvät niillä matkoilla. Toivotaan että sikäläinen kansa joka provinssisa huomaa maan turismiarvon ja osaa hyödyntää sitä rauhanomaisissa olosuhteissa omaksi edukseenkin.