Nat Commun. 2013;4:2274. doi: 10.1038/ncomms3274.
Genome sequence of the date palm Phoenix dactylifera L.
Date
palm (Phoenix dactylifera L.) is a cultivated woody plant species with
agricultural and economic importance. Here we report a genome assembly
for an elite variety (Khalas), which is 605.4 Mb in size and covers
>90% of the genome (~671 Mb) and >96% of its genes (~41,660
genes). Genomic sequence analysis demonstrates that P. dactylifera
experienced a clear genome-wide duplication after either ancient whole
genome duplications or massive segmental duplications. Genetic diversity
analysis indicates that its stress resistance and sugar
metabolism-related genes tend to be enriched in the chromosomal regions
where the density of single-nucleotide polymorphisms is relatively low.
Using transcriptomic data, we also illustrate the date palm's unique
sugar metabolism that underlies fruit development and ripening. Our
large-scale genomic and transcriptomic data pave the way for further
genomic studies not only on P. dactylifera but also other Arecaceae
plants.
Katson taatelista hieman jonkin proteiinin rakennetta. Tässä on sen xylanaasin rakenne ja siinä mahdollisesti olevia proliineja ja glutamiineja. havaitsen muutamia glutamiinidipeptidijaksoja QQ ja sitten on vain yksittäisiä proliineja tai glutamiineja muutamia siellä täällä.
Katson taatelista hieman jonkin proteiinin rakennetta. Tässä on sen xylanaasin rakenne ja siinä mahdollisesti olevia proliineja ja glutamiineja. havaitsen muutamia glutamiinidipeptidijaksoja QQ ja sitten on vain yksittäisiä proliineja tai glutamiineja muutamia siellä täällä.
ORIGIN
1 mrallmllsw vflqwqlafg asydgprydy yastecktyp eaplydggil adrtgkipmt
61 yykmetgvys pafvlynltg ttrytfscwv kikgtvstll karlstetst skcvgtasak
121 sscwsflkgg fvldspsqts ilyfqdvean naieisvtsp slqpfsveqw ktqqeenirt
181 krkrvatvhv sdsqgnhitg asvtaqqlsk dfpfgsaiak tilgntayqa wfakrfnaav
241 fenelkwytt epepgklnyt ladellefvr anqivarghn ifwedpkytp swvqnltgde
301 lraavksrid slltrykgef vhwdvsneml hfdfyeqrlg ynatfdffat aqqsdpyatl
361 fmndfnviet cddvnstvds yasrlkeike gggvlegigl eghfskpnfp lmravldkla
421 tlklpiwlte idisnsfdqq tqwnwkeidt tcrivanyyt
Inga kommentarer:
Skicka en kommentar