Ohran (Barley, Hordeum vulgare) prolamiineista ja gluteliineista

Ohran nimi on  HORDEUM VULGARE.

• Ohran PROLAMIININ  nimi on hordeiini.

Omega-tyyppinen hordeiini on nimeltään C-hordeiini.
 http://www.uniprot.org/uniprot/P06472

        10         20         30         40         50
QPQQSYPVQP QQPFPQPQPV PQQRPQQASP LQPQQPFPQG SEQIIPQQPF 
        60         70         80         90        100
PLQPQPFPQQ PQQPLPQPQQ PFRQQAELII PQQPQQPLPL QPHQPYTQQT 

IWSMV   

Lisäksi  ohraprolamiineissa on gamma-tyypistä hordeiinia. Löytyy  gamma-1 ja gamma 3- hordeiineja. 

 Gamma-hordein-3
"Sulfur-rich hordein which possesses an N-terminal half composed of proline-glutamine blocks organized in repeating units and a C-terminal half where the repeats are dispersed and less conserved"
http://www.uniprot.org/uniprot/P80198

        10         20         30         40         50
ITTTTMQFNP SGLELERPQQ LFPQWQPLPQ QPPFLQQEPE QPYPQQQPLP 
        60         70         80         90        100
QQQPFPQQPQ LPHQHQFPQQ LPQQQFPQQM PLQPQQQFPQ QMPLQPQQQP 
       110        120        130        140        150
QFPQQKPFGQ YQQPLTQQPY PQQQPLAQQQ PSIEEQHQLN LCKEFLLQQC 
       160        170        180        190        200
TLDEKVPLLQ SVISFLRPHI SQQNSCQLKR QQCCQQLANI NEQSRCPAIQ 
       210        220        230        240        250
TIVHAIVMQQ QVQQQVGHGF VQSQLQQLGQ GMPIQLQQQP GQAFVLPQQQ 
       260        270        280 
AQFKVVGSLV IQTLPMLCNV HVPPYCSPFG SMATGSGGQ  

Gamma-hordein-1
http://www.uniprot.org/uniprot/P17990

• Ohran GLUTELIINIOSA

Ohran gluteliineilla on  alayksiköt HMW( korkeamolekyylipainoinen)  ja LMW (matalampimolekyylipainoinen.

Ohran gluteliinin   LMW  alayksikkö  koostuu B-hordeiineista, joiden C-terminaalit  muistuttavat  vehnän  gluteliinien LMW alayksikköjä.
 B-hordeiinien N-terminaalit käsittävät  vain toistojaksoja, jotka ovat  gamma-hordeiinien (ohraprolamiinien)  toistojaksojen kaltaisia.

B-hordeiinin sekvenssi löytyy netistä.

http://www.uniprot.org/uniprot/Q0PIV6

MKTFLVFALL VIAATSTIAQ QQPFPQQPFP QQPQPYPQQP QPYPQQPFQP 
        60         70         80         90        100
QQPFPQQPQP YPQQPQPYPQ QPQPFPQQPF PSQQPFPQQP PFWQQQPVLS 
       110        120        130        140        150
QQQPCTQDQT PLLQEQQDQM LLQVQIPFVH PSILQQLNPC KVFLQQQCSP 
       160        170        180        190        200
VAMSQRIARS QMLQQSSCHV LQQQCCQQLP QIPEQIRHEA VRAIVYSIVL 
       210        220        230        240        250
QEQPLQLVQG VSQPQKQLGQ QQVGQCSFQQ PQPQQVGQQQ QVPQSAFLQP 
       260        270        280        290
HQIAQFEATT SIALRTLPTM CSVNVPSYRI LRGVGPSVGV